Page 9 - 《西北农业学报》2022年第6期
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6 期 赵长江等: 玉米 BBX 基因家族鉴定及表达分析 · 6 8 1 ·
Bd1-5 代表二穗短柄草 5 条染色体, Zm1-10 代表玉米 10 条染色体, Os1-12 代表水稻 12 条染色体; 红色线条为玉米物种内的片段重
复基因对, 橙色线条为玉米和二穗短柄草间的片段重复基因对; 紫色线条为玉米和水稻间的片段重复基因对; 青色线条为水稻和二穗短
柄草间的片段重复基因对
Bd1-5re p resents5chromosomesofBrach yp odiumdistach y on , Zm1-10re p resents10chromosomesofZeama y s ( Zm ), andOs1-12
re p resents12chromosomesofOr y zasativa ( Os ); theredlineisthefra g mentre p eatg enep airwithintheZea ma y ss p ecies , theoran g e
lineisthefra g mentre p eat g ene p airbetweenZeama y sandBrach yp odiumdistach y on ( Bd ), andthe p ur p lelineisthefra g mentre p etitive
g ene p airbetweenZeama y sandOr y zasativa ; thec y anlineisthefra g mentredundant g ene p airbetweenOr y zasativaandBrach yp odi-
umdistach y on
图 2 ZmBBX 家族染色体定位( A ) 及二穗短柄草、 玉米、 水稻间共线性( B )
(
Fi g .2 ChromosomelocationofZmBBXfamil y A ) andcollinearit y anal y sisamon g
Brach yp odiumdistach y on , Zeama y sandOr y zasativa ( B )
2.4 ZmBBX 家族基因结构及编码蛋白保守结构 B-box 保 守 域 ( Motif3 ); ZmBBX1 、 ZmBBX2 、
分析 ZmBBX3 、 ZmBBX5 、 ZmBBX9 、 ZmBBX12 、 ZmB-
保守结构域分析发现成员含有 2~8 个保守 BX13 、 ZmBBX15 、 ZmBBX19 、 ZmBBX21 、 ZmB-
基序( 图 3-A 、 3-C ), 所有成员均含有 B-box 结构 BX22 、 ZmBBX26 、 ZmBBX29 、 ZmBBX30 、 ZmB-
BX31 、 ZmBBX32 和 ZmBBX3317 个 成 员 除 了 具
域核 心 序 列 ( Motif1 )。 其 中 ZmBBX4 、 ZmB-
有典型的 B-box 结 构 域 外, 还 含 有 CCT 结 构 域
BX5 、 ZmBBX6 、 ZmBBX7 、 ZmBBX8 、 ZmB-
BX11 、 ZmBBX12 、 ZmBBX13 、 ZmBBX16 、 ZmB- ( Motif3 )。
对 ZmBBX 家族成员的基因内含子和外显子
BX18 、 ZmBBX19 、 ZmBBX20 、 ZmBBX21 、 ZmB-
BX23 、 ZmBBX24 、 ZmBBX27 、 ZmBBX28 、 分析( 图 3-B ), 第 Ⅰ 组 成 员 内 含 子 数 量 为 1~5
ZmBBX31 和 ZmBBX34 19 个 成 员 含 有 另 一 个 个, 第 Ⅱ 组为 0~3 个, 第 Ⅲ 组和 Ⅳ 均为 3~4 个,