Page 9 - 《西北农业学报》2021年第10期

10 期 丁燕玲等: 牛 miR-615 潜在生物学功能分析及其组织表达鉴定 · 1 4 3 9 ·

表 4 miR-615 潜在靶基因的 GO 注释
Table4 GOannotationsofmiR-615p redictedtar g et g enes
GO 条目 P 值 数目 基因列表
GOterm P value Count Genelist
RNA 聚合酶 Ⅱ 转录因子活性
分子功能 FOXK1 , ETS1 , SPIB , NFIX , NFIC ,
RNA p ol y merase Ⅱ transcri p tionfac- 0.0009 7
Molecularfunction JUND , RUNX3
toractivit y
序列特异性 DNA 结合 GTPase激活剂
活性 ARRB1 , MYO9B , TBC1D25 , ARHGDIG ,
0.0106 6
Se q uence-s p ecificDNAbindin gGTPase CDC42EP2 , TBC1D10C
activatoractivit y
RNA 聚 合 酶 Ⅱ 调 控 区 序 列 特 异 性
DNA 结合
0.0273 5 FOXK1 , TEF , SNAI1 , DMBX1 , OSR2
RNA p ol y merase Ⅱ re g ulator yre g ion
se q uence-s p ecificDNAbindin g
组蛋白去甲基酶活性
0.0358 2 PHF8 , KDM6B
Histonedemeth y laseactivit y
细胞组分 细胞核 CAPN15 , KCNH1 , TBC1D10C , KSR2 ,
0.0221 11 SPSB1 , MAP3K9 , RPH3AL , RAB24 ,
Cellcom p onents Intracellular
SHC1 , SHANK3 , UNC13A
核膜
0.0441 3 KCNH1 , CLIP3 , PMEPA1
Endosomemembrane
生物学过程 转录正调控 KLF7 , OSR2 , FOXK1 , SERTAD3 ,
0.0010 9 SNAI1 , MAPRE3 , RUNX3 , BRCA1 , IF-
Biolo g ical p rocess Positivere g ulationoftranscri p tion
NAR1
RNA 聚合酶 Ⅱ 启动子转录的正调控 VDR , SSBP3 , THRA , OSR2 , NOS1 ,
Positive re g ulation of transcri p tion 0.0064 12 ARRB1 , ETS1 , JUND , NFIX , NFIC ,
from RNAp ol y meraseⅡ p romoter KDM6B , BRCA1
钙离子调节的神经递质胞吐
Calcium ion-re g ulated exoc y tosis of 0.0251 3 SYT3 , RPH3AL , RIMS4
neurotransmitter
基因表达的正调控
0.0267 5 AMH , OSR2 , LDLR , CD3E , FN1
Positivere g ulationof g eneex p ression
表 5 miR-615 潜在靶基因 KEGG 通路富集分析
Table5 KEGGp athwa y enrichmentanal y sisoftar g et g ene p redictedb ymiR-615
KEGG 条目 P 值 数量 基因列表
KEGGterm P value Count Genelist
FGF19 , CCND2 , ITGA7 , FGF11 , BRCA1 , FN1 , IF-
PI3K-Akt信号通路 PI3K-Aktsi g nalin gp athwa y 0.0238 7
NAR1
FGF19 , ARRB1 , MAP2K3 , JUND , FGF11 , CAC-
MAPK 信号通路 MAPKsi g nalin gp athwa y 0.0240 6
NA1C
麻疹 Measles 0.0620 4 RAB9B , CD3E , CCND2 , IFNAR1
Ros信号通路 Rossi g nalin gp athwa y 0.0652 5 FGF19 , KSR2 , ETS1 , FGF11 , SHC1
心律失常性右心室心肌病
0.0663 3 ITGA7 , CDH2 , CACNA1C
Arrh y thmo g enicri g htventricularcardiom y o p ath y
醛固酮合成与分泌 Aldosterones y nthesisandsecretion 0.0928 3 LDLR , CACNA1C , KCNK3
过程 [ 28 ] 。牛IGF2 基因定位 于 29 号 染 色 体, 由
3 讨 论
10 个外显子组成, 该染色体包含牛的产肉、 产奶
胰岛 素 样 生 长 因 子 2 ( Insulin-likeg rowth 和健康性状的数量性状位点 [ 29-30 ] 。研究发现秦川
factor2 , IGF2 ) 是 一 种 胎 儿 生 长 分 化 因 子, 在 肌 牛IGF2 基因内含子3 序列中 3106b p 位置附近
肉生长和成肌细胞增殖分化中起重要作用 [ 26 ] , 高 的序列是转录因子 ZBED6 在牛基因组上的结合
表达 IGF2 时, 可 以 促 进 肌 肉 的 形 成, 而 当 IGF2 位点, 干扰 ZBED6 后, 对 IGF2 基因的表达具 有
基因被抑制时, 则阻碍肌肉 生 成 [ 27 ] 。 IGF2 基 因 明显抑制作用, 从而阻碍了肌肉的生成; 而过表达
后则促进IGF2 基因表达, 并加快肌肉的生长发
是 miR-615 的 预 测 靶 基 因, 大 量 研 究 证 明 IGF2
基因在肌肉生长发育中起着极其重要的作用, 它 育 [ 31 ] 。本试 验 所 得 结 果 中 IGF2 是 miR-615 的
可以与肌肉发育相关的转录因子作用从而调控其 靶 基 因 之 一 , 牛 miR-615 是 否 通 过 IGF2 基 因 调