Page 7 - 《西北农业学报》2022年第1期

１ 期 曲 亮等：育成期高能饲喂下开产与未开产蛋鸡肝脏转录组差异分析 · ３ ·

表 ３ 基因鉴定
犜犪犫犾犲３ 犐犱犲狀狋犻犳犻犮犪狋犻狅狀狅犳 犵 犲狀犲

基因序列 外显子序列 内含子序列 基因间序列 基因组序列
（占基因组比例） （占基因比例） （占基因比例） （占基因组比例） （占纯净序列比例）
样品
Ｇｅｎｅｒｅａｄｓ Ｅｘｏｎｒｅａｄｓ Ｉｎｔｒｏｎｒｅａｄｓ Ｉｎｔｅｒ ｇ ｅｎｅｒｅａｄｓ Ｇｅｎｏｍｅｒｅａｄｓ
Ｓａｍ ｐ ｌｅ
（ Ｐｒｏ ｐ ｏｒｔｉｏｎｔｏ （ Ｐｒｏ ｐ ｏｒｔｉｏｎｔｏ （ Ｐｒｏ ｐ ｏｒｔｉｏｎｔｏ （ Ｐｒｏ ｐ ｏｒｔｉｏｎｔｏ （ Ｐｒｏ ｐ ｏｒｔｉｏｎｔｏ
ｇ ｅｎｏｍｅｒｅａｄｓ ） ｇ ｅｎｅｒｅａｄｓ ） ｇ ｅｎｅｒｅａｄｓ ） ｇ ｅｎｏｍｅｒｅａｄｓ ） ｃｌｅａｎｒｅａｄｓ ）
Ｎ１ ５７０１５１０６ （ ８４．９１％ ） ４１６２１０２７ （ ７３．００％ ） １５３９４０７９ （ ２７．００％ ） １０１３２５８７ （ １５．０９％ ） ６７１４７６９３ （ ８１．３０％ ）
Ｎ２ ５８０４８２８２ （ ８９．５２％ ） ４８３２５１９５ （ ８３．２５％ ） ９７２３０８７ （ １６．７５％ ） ６７９５６４３ （ １０．４８％ ） ６４８４３９２５ （ ７９．７９％ ）

Ｎ３ ５６４３９７０４ （ ８５．５８％ ） ４２１２６５９５ （ ７４．６４％ ） １４３１３１０９ （ ２５．３６％ ） ９５０９９３８ （ １４．４２％ ） ６５９４９６４２ （ ７９．７２％ ）
Ｒ１ ５８５７４２３５ （ ８７．６１％ ） ４５７４６４７７ （ ７８．１０％ ） １２８２７７５８ （ ２１．９０％ ） ８２８３６９８ （ １２．３９％ ） ６６８５７９３３ （ ８０．９６％ ）
Ｒ２ ５６９２３０６２ （ ８７．３８％ ） ４５１５１３７３ （ ７９．３２％ ） １１７７１６８９ （ ２０．６８％ ） ８２２１２０７ （ １２．６２％ ） ６５１４４２６９ （ ８１．０８％ ）
Ｒ３ ５９４７６８０３ （ ８８．９１％ ） ４８６０４４４３ （ ８１．７２％ ） １０８７２３６９ （ １８．２８％ ） ７４１８７１３ （ １１．０９％ ） ６６８９５５１６ （ ８３．２２％ ）

２．２ 肝脏基因差异表达分析 调基因）见表 ４ ，可以看出，未开产鸡有 ７ 个基因
对鉴定出的基因进行 ＲＰＫＭ 表达量分析，并 未检出表达，开产鸡有 ５ 个基因未检出表达，上调
对开产与未开产样品的基因表达量进行比较分 和下调差异为 １０～３０００ 倍，提示它们可能对开
析，筛选出差异表达基因（图 １ ），共筛选出 ４９４ 个 产性状具有特殊的重要作用。
差异表达基因（ 犘＜ ０．０５ ），相比未开产鸡，开产鸡 挑选部分差异表达基因进行 ＲＴＰＣＲ 验证
ｑ
有 ２８５ 个基因上调， ２０９ 个基因下调。对差异表 （图 ３ ），结 果 可 见， ４ 个 基 因 表 达 量 的 ＲＴＰＣＲ
ｑ
达基因进行聚类分析（图 ２ ），结果可见，基因大多 结果与 ＲＮＡｓｅ ｑ 结果基本一致，说明差异表达基
汇聚在同一大类，说明它们具有相关的功能。表 因分析结果较可靠。
达差异最大的 ２０ 个基因（ １０ 个上调基因， １０ 个下

图 １ 差异表达基因火山图
犉犻 犵 ．１ 犞狅犾犮犪狀狅犿犪 狆狅犳犱犻犳犳犲狉犲狀狋犻犪犾犾 狔 犲狓 狆 狉犲狊狊犲犱 犵 犲狀犲狊